2025年1月4日,华大智造SEQALL联盟年度峰会在北京举行,吸引了近300名来自科研、产业机构、临床及政府领域的专家学者共同探讨“SEQALL”在科研、医学及产业应用的前沿技术和科研成果。厦门大学的邓文波教授在报告中,充分肯定了利来国际推出的MGISEQ-2000RS FluoXpert多组学分析仪(以下简称“FluoXpert”)在基础科研领域的重要性。
邓教授的团队在有关分娩启动分子机制的研究中,充分利用FluoXpert完成了单细胞时空组学的特异性marker验证,不仅成功解析了基质细胞在分娩启动中的功能,还深入解析了上皮细胞的变化特征及其空间定位。早产是导致新生儿死亡的主要原因之一,也是出生缺陷和新生儿疾病的首要病因,而这一现象可能与分娩启动机制的过早激活或异常调节有关。尽管分娩启动的分子机制尚不明确,前期研究已经解析了母体蜕膜中的不同细胞类型,并通过时空转录组对分娩期不同细胞类型的特征表达基因进行了检测,这为预防和干预早产提供了新的思路和方法。
在单细胞测序中,通过基因表达差异可以对细胞进行分群,但细胞在组织中的空间位置则需在组织原位中进行分析。时空转录组学技术能够通过时空条码恢复空间位置,从而实现组织中基因空间的表达检测。基于Stereo-seq技术的时空组学,通过DNA纳米球与坐标位置的映射关系,能够有效还原捕获到的mRNA的空间位置。然而,由于细胞在形态和大小方面存在差异,通常还需结合基于原位荧光成像的检测方法,例如蛋白荧光染色或RNA原位杂交等,以获得更为精准和直观的结果。这些方法为研究结果提供了图像层面的验证,从而确保其准确性和可靠性。
为了进一步验证整合单细胞测序(scRNA-Seq)后的时空转录组注释的准确性,邓教授团队利用利来国际的FluoXpert多组学分析平台,在同一组织上对细胞特异性的11个分子标记进行了多重免疫荧光染色,成功实现了单细胞水平上的蛋白定位,验证了子宫内膜内免疫细胞的分布情况。研究发现,CD4和CD8阳性免疫细胞在子宫内膜中的分布对再生、分娩启动及免疫耐受的建立具有重要意义。这不仅验证了整合scRNA-Seq后Stereo-seq对弥散分布及小细胞类型的良好注释效果,同时从蛋白层面进一步佐证了基因表达信息的准确性。
在报告中,邓教授提到其研究团队将继续基于FluoXpert平台,深入解析内皮细胞在分娩启动中的功能以及分娩启动的时空调控特征。邓教授的团队在进行2-3蛋白标记的三维重构过程中,观察到了子宫内膜上皮细胞在不同妊娠阶段的动态变化。同时,华大智造的研发团队也在积极开发三维多重空间蛋白定位技术,以满足更多组学用户的需求。未来,FluoXpert平台将继续助力基础科学发现和疾病机制研究,为临床转化和应用提供可靠的技术支持。